Plateforme bio-informatique de l’Institut Curie de Paris

Missions

L’intégration de données omiques, l’analyse de données omiques et autres, le développement de méthodes et outils bio-informatiques et biostatistiques.
Données concernées : toute application de grand séquençage, tout type de puces, spectrométrie de masse, phénotypage à haut débit, données bas débit.
Formations en bio-informatique et biostatistiques.
Participation à la coordination de la communauté (APLIBIO, IFB, France Génomique…)
Activité principale en oncologie moléculaire.

Expertise

Environnement bio-informatique :

analyse grand séquençage (variants de séquence (exomes et génomes), HiC et autres C-seq, ChIPseq, smallRNA seq, RNAseq)
analyse de puces génome, transcriptome et protéome (RPPA)
analyse de spectrométrie de masse
analyse de données de phénotypage cellulaire à haut débit

Participation à des essais cliniques en oncologie.
Développement d’un système d’information pour l’intégration de données hétérogènes.
Mise en place et gestion avec l’équipe système d’un cluster de calcul, etc.