Plateforme de bio-informatique de Lille
bilille propose une palette de services de proximité diversifiés, du conseil à l’accompagnement dans vos projets, que vous soyez débutant ou plus expérimenté.
Le périmètre scientifique de bilille couvre notamment : l’analyse de données omiques, l’annotation de séquences, la phylogénie, la biologie des systèmes, la bioinformatique structurale, la biologie intégrative, l’analyse de données de criblage à haut contenu et l’analyse de données d’imagerie.
Equipements
bilille offre des moyens de calcul à haute performance sous la forme d’un cloud, ouvert à tous les personnels académiques de la métropole lilloise ayant des besoins en ressources de calcul pour la bioinformatique. Ces moyens sont hébergés au sein du Mésocentre de l’Université de Lille.
Il s’agit d’un cloud openstack disposant de
- 264 coeurs CPUs, 2.19 To RAM, 140 To stockage, réseau 10 Gbs dédiés
- 96 coeurs CPUs, 768 Go RAM intégrés à la fédération nationale Biosphère (IFB)
Principales réalisations
- visCorVar, package R pour la visualisation des résultats d’intégration de données multi-blocs (publication à venir, http://wikis.univ-lille.fr/bilille/galaxy-viscorvar)
- Norine, ressource pour les peptides non ribosomiques (http://bioinfo.lifl.fr/norine/)
- mirkwood, identification de microARN dans les génomes de plantes (http://bioinfo.lifl.fr/mirkwood/)
- MATAM, assemblage ciblé de métagénomique (http://github.com/bonsai-team/matam)
- SortMeRNA, tri et alignement de lectures de marqueurs conservés en métagénomique (http://bioinfo.lifl.fr/RNA/sortmerna/)
- RNAspace, plateforme d’annotation des ARN non-codants (http://www.rnaspace.org/)
Formations
bilille organise des formations en bioinformatique en lien avec les services formations du CNRS, de l’Université de Lille et de l’Inserm. Des formations dédiées aux doctorants du collège doctoral de l’Université de Lille ainsi qu’aux entreprises via CNRS Formation Entreprises sont également proposées. Des journées scientifiques et des séminaires techniques ouverts à tous sont organisés tout au long de l’année.
MAJ : 28 juillet 2021
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Responsables de la Plateforme
Guillemette Marot (responsable scientifique)
Pierre Pericard (co-responsable technique)
Jimmy Vandel (co-responsable technique)
bilille vous accueille sur 3 sites :
- Bâtiment ESPRIT, avenue Paul Langevin, 59650 Villeneuve-d’Ascq
- Pôle Recherche de la Faculté de Médecine, 1 Pl. de Verdun, 59000 Lille
- Campus Pasteur Lille, 1 Rue du Professeur Calmette, 59000 Lille
Tutelles
Université de Lille, CNRS, Inserm, Institut Pasteur de Lille, CHU
Contacts
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