Les Microbiomes Coralliens, Réservoirs Uniques Pour La Découverte De Nouveaux Produits Naturels
Les récifs coralliens sont les « forêts tropicales de la mer », abritant un tiers de toutes les espèces marines macroscopiques. Cependant, leur véritable diversité est microbienne, c’est-à-dire invisible à l’œil nu. En analysant 820 échantillons de microbiomes provenant de 99 récifs différents à travers l’océan Pacifique, collectés lors de l’expédition Tara Pacific et financé en partie par France Génomique, ces travaux ont permis de cartographier le paysage microbien des coraux constructeurs de récifs à une échelle sans précédent.
L’équipe en partie constituée de chercheurs, ingénieurs et techniciens du Genoscope a reconstitué le génome de 645 espèces microbiennes et a découvert que plus de 99 % d’entre elles n’avaient jamais été décrites sur le plan génomique. Ces microbes ne sont pas simplement de passage ; ce sont des résidents très spécifiques de leurs hôtes coralliens qui agissent comme des ingénieurs chimiques prolifiques. L’étude a révélé que ces bactéries associées aux coraux contiennent une plus grande variété de « clusters de gènes biosynthétiques », en quelque sorte les recettes pour des produits naturels, que ce qui a été documenté jusqu’à présent dans l’ensemble de l’océan ouvert mondial.
La caractérisation biochimique d’enzymes et de composés jusqu’alors inconnus suggère un immense potentiel inexploité pour la biotechnologie et la médecine. Cette recherche met en évidence une dimension critique, souvent négligée, de la conservation : lorsque les récifs coralliens meurent, nous ne perdons pas seulement les coraux, les éponges et les poissons, nous perdons une vaste «bibliothèque moléculaire» de vie microbienne. Les résultats soulignent que la protection des récifs doit inclure une perspective microbienne afin de préserver la diversité chimique unique qui permettra de futures percées scientifiques.
