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IRIGIN - International RIce Genome INitiative

Le projet IRIGIN (International RIce Genomic INitiative) est la contribution française au programme de séquençage massif des riz, initié par l’IRRI (International Rice Research Institut, Philippines, centre du CGIAR) et le BGI (Beijin Genomic Institut, Chine) par le séquençage de 3000 variétés de riz asiatique. IRIGIN est coordonné par l’IRD, en collaboration avec le CIRAD, le CIAT (Colombie, centre du CGIAR) et AfricaRice (organisme panAfricain du CGIAR), le tout au sein du Mégaprogramme GRiSP (Global Rice Science Partnership, CGIAR).
IRIGIN est ciblé sur le séquençage de matériel d’iintérêt agronomique et évolutif, tels que les riz africains, les NAMs (Nested Association Mapping populations, créées pour optimiser la découverte de gènes), ou les populations de sélection génomique. Ce n’est pas moins de 7000 lignées qui seront séquencées, avec des couvertures de 1 à 35x, pour un total de 17000 fois le génome du riz. Les nombreux attendus de ce projet ambitieux sont, de manière non-exhaustive :
- la découverte de gènes d’intérêt,
- l’optimisation des sélections au champs pour produire plus rapidement des variétés aptes à résister au changement climatique,
- la compréhension de la structure du génome globale d’une espèce entière et des modifications subies suite à une spéciation,
- l’identification des mécanismes à la base des syndromes de dédomestication,
- et bien d’autres encore…

Les données produites, une fois traitées, seront disponibles sous licence Open Source pour l’intégralité de la communauté scientifique, sur le site http://irigin.org.