La Plateforme transcriptOmique de Paris Saclay, POPS, localisée à Gif sur Yvette (91), a été créée en 2003 et a pour mission principale de proposer un panel de prestations techniques et bio-informatiques pour l’analyse du transcriptome des plantes. C’est le « service intégré à façon ».

POPS permet à une communauté scientifique publique ou privée de répondre à des questions biologiques grâce au séquençage à haut débit des ARNs couramment nommé le RNA-Seq. Nous réalisons des projets d’étude en collaboration avec des équipes de recherche nationales et internationales. Nous avons fait le choix de nous spécialiser exclusivement sur les végétaux afin d’avoir une expertise forte et de conseiller au mieux nos collaborateurs sur leurs projets. A ce jour, nous avons travaillé sur plus de 93 espèces différentes.

Notre champ d’application implique de rester à la pointe de la technologie dans le domaine du séquençage et de l’analyse des données afin de proposer des protocoles techniques et des analyses bioinformatiques les plus pertinents et intéressants tant sur le plan biologique que financier, notre seconde mission est le « développement ».

Enfin transmettre le savoir acquis grâce à la communauté est important. La plateforme dispense des formations, participe à des enseignements, coorganise les « journées omiques végétales » et accueille des stagiaires. C’est un aspect essentiel nommé « Formation & animation scientifique ».

Prestations

Riche de son expertise dans les végétaux, POPS propose différents protocoles et analyses pour réponse aux questions biologiques des utilisateurs. Les différentes étapes pour mener un projet sont les suivantes :

(*Ces étapes peuvent être prises en charge par les collaborateurs.)