La plateforme GENTYANE est rattachée à l’INRAE (Centre Auvergne Rhône Alpes) et plus particulièrement au Département Biologie et Amélioration des Plantes (BAP).

La plateforme a pour objectifs scientifiques :
(1) d’appuyer les recherches conduites dans les différentes équipes de l’UMR GDEC
(2) de réaliser des prestations de génotypage et séquençage pour le compte d’autres équipes INRAE ou d’autres organismes publics et privés
(3) d’assurer une veille technologique permettant de mettre en place de nouveaux outils répondant mieux, plus rapidement et à un coût moindre aux attentes des utilisateurs.

L’équipe est composée d’ingénieurs et de techniciens, experts en génotypage et séquençage. Nous disposons d’un bâtiment avec toutes les sécurités : électrique, incendie et contrôle d’accès.

Expertise

Séquençage de novo, reséquençage, RNAseq, DGE, small RNAseq, ChIPseq, HiC, mise en évidence de variants, RRBS. La plateforme propose également des pipelines d’analyse statistique complet pour identifier les transcrits différentiellement exprimés, les régions liées par des facteurs de transcription, les amplifications/délétions génomiques, les régions méthylées.