Plateforme de séquençage de Paris – Genom’IC Institut Cochin
GENOM’IC est une des plateformes technologiques de l’Institut Cochin (INSERM U1016 – CNRS UMR8104 – Université Paris Descartes) labélisée IBISA et ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique académique, industrielle et hospitalière.
GENOM’IC propose des prestations de service certifiées ISO 9001 V2015 / NFX50-900 en analyse transcriptomique à différentes échelles : des analyses par RNA-seq bulk couvrant tous les types d’ARN (RNA codants et non codants, petits ARN) de quelques cellules triées jusqu’à un tissu complexe, des analyses de la cellule unique par scRNA-seq (basées sur la technologie 10X Chromium) et des analyses spatiales par transcriptomique spatiale en partenariat avec HISTIM (basée sur la technologie 10X Visium).
GENOM’IC propose la production de données et leur analyse bio-informatique soit en interne, soit via la plateforme BIOINFORMAT’IC nouvellement crée. GENOM’IC propose également des analyses épigénétiques (Chip-seq, Cut&tag, ATAC-seq) en couplant production et analyse des données et le contrôle qualité d’ARN extraits par les équipes. GENOM’IC collabore également à la mise en place de technologies innovantes et met à disposition son parc d’appareils de PCR en temps réel et digitale pour les équipes de l’Institut Cochin.
L’équipe est composée de 6 personnes (ingénieur, assistant ingénieur, technicien) avec des compétences en biologie moléculaire et en bio-informatique.
Expertise
- Contrôle qualité des échantillons biologiques
- Analyse du transcriptome tissulaire (mRNA, ncRNA, small RNA) par RNA-seq bulk (technologie Illumina)
- Analyse du transcriptome / épigénome cellulaire par sc RNA-seq (technologie Chromium de 10X Genomics)
- Analyse du transcriptome tissulaire (technologie Visium de 10X Genomics)
- Analyses épigénomiques (ATAC-seq, Cut&Tag, Chip-seq)

Equipements
- 1 Nextseq 2000, 1 MiSeq (Illumina)
- 1 Chromium iX (10X Genomics)
- 1 CytAssist (10X Genomics)
- 4 LightCycler 480 (Roche)
- 1 droplet Generator (Biorad)
- 1 Tapestation et 1 bioanalyseur 2100 (Agilent)
Mise à jour : Aout 2025

Certification / Assurance qualité
Les prestations fournies par GENOM’IC sont certifiées ISO9001 V2015 et NFS50-900.
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Labélisée IBISA, GENOM’IC est référencée parmi les plateformes du SIRIC Carpem et les plateformes de l’Université Paris Cité.

Responsables de la Plateforme
Franck Letourneur
Plateforme GENOMIC
Batiment G Roussy 3ème étage
27 rue du faubourg Saint Jacques
75014 Paris