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Plateforme de séquençage ProfilExpert

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ProfileXpert (www.profilexpert.fr) est une plateforme de génomique et microgénomique de l’Université Lyon1 rattachée à la SFR santé Lyon-Est (UCBL UMS 3453 CNRS – US7 INSERM).
Ses activités se divisent en 3 parties
- des prestations de service en génomique, transcriptomique, épigénomique, régulomique et métagénomique principalement par les technologies de séquençage nouvelle génération à destination des laboratoires publics ou privés ou des entreprises
- des projets de recherche et développements en partenariat avec des laboratoires académiques ou des sociétés privées (ANR, FEDER, FUI et projets européens)
- une activité de formation.

Equipements
-  Séquenceurs MiSeq, NextSeq 500 et HiSeq2500 (Illumina), MinION (Oxford Nanopore)
-  Microdissecteur laser PixCell II (Arturus)
-  Analyse Cellules uniques : DEParray ( Silicon Biosystem) ; C1 single cell autoprep system (Fluidigm)
-  2 stations Affymetrix et 1 station Iscan (Illumina)
-  1 serveur HP (calculs)

Principales réalisations
La plateforme est spécialisée dans les études de génomique, transcriptomique, épigénomique et métagénomique (microbiome, virome, fungiome) à partir de microquantités de matériels biologiques. Les échantillons peuvent être issus de tri par FACS ou par microdissection laser ou à partir de cellules uniques. La plateforme est également spécialisée dans l’analyse d’échantillons dégradés (FFPE, tissus infectés désactivés chimiquement ou par la chaleur).

Labels/ Démarche qualité
La plateforme est certifiée ISO 9001 et NFX 50-900 et d’autre part autorisée MOT (autorisation donnée par l’ANSM pour manipuler des produits de microorganismes pathogènes et toxines).

En savoir plus http://profilexpert.fr/

Responsables de la plateforme
Joël Lachuer, PhD
Directeur de la plateforme

Contact
contact@profilexpert.fr

mise à jour : 2018/03


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