Mutualisation des compétences et des équipements français
pour l’analyse génomique et la bio-informatique

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Plateforme de séquençage Institut Cochin

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Plateforme de Génomique GENOM’IC
Institut Cochin Paris 14e
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GENOM’IC est la plateforme technologique de l’Institut Cochin (INSERM U1016 - CNRS UMR8104 – Université Paris Descartes) ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique académique, industrielle et hospitalière. Spécialisée dans l’étude du génome et du transcriptome, GENOM’IC prend en particulier en charge des projets d’analyse de transcriptome basés sur les puces à ADN et le séquençage haut débit (NGS) en couplant la production de données de qualité et leur analyse bio-informatique. GENOM’IC collabore également à des projets innovants en mettant à disposition ses compétences techniques et en assurant une veille technologique constante. La démarche qualité engagée depuis 2012 permet de garantir la qualité des manipulations réalisées (certifiées ISO9001) et des données produites et de répondre aux exigences de ses clients.
L’équipe est composée de 7 personnes, ingénieurs, assistant ingénieur, techniciens, avec des compétences en biologie et bio-informatique.

Principales prestations :

Contrôle qualité des échantillons biologiques (ARN, ADN)
Détection de cibles multiples par hybridation (technologie Nanostring)
Analyse du transcriptome par puces à ADN (technologie Affymetrix)
Analyse du transcriptome (mRNA, ncRNA, small RNA) par NGS (technologie Illumina)
Séquençage ciblé après capture (Exome entre autre) et PCR multiplexée (technologie Ion torrent)
Séquençage de petits génome

Equipements :
2 bioanalyseurs Agilent 2100
1 station Affymetrix GCS3000 7G (1 scanner, 3 fluidiques, 3 fours)
1 Nextseq 500 Illumina, 1 MiSeq Illumina, 1 PGM, 1 S5XL, 2 Ion Chef (Ion Torrent)
1 Prepstation Nanostring
4 LightCycler 480 Roche

Labels/ Démarche qualité

GENOM’IC est labellisée plateforme génomique de l’Université Paris Descartes et certifiée ISO9001 depuis 2012.

En savoir plus :
https://www.institutcochin.fr/les-plateformes/genomique-et-transcriptomique

Responsable de la plateforme :
Franck Letourneur
Contact : u1016-genomique@inserm.fr

mise à jour : février 2018