Mutualisation des compétences et des équipements français
pour l’analyse génomique et la bio-informatique

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Plateforme de séquençage POPS

Principales réalisations

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La Plateforme transcriptOmique de l’iPS2 (POPS) propose :

1. Une expertise pour l’analyse de l’expression des gènes chez les plantes par l’utilisation du séquençage à haut-débit de l’ARN (RNA-seq directionnel, Small RNA-seq, Ultralow RNA-seq, empreintes …).
Cette offre est complétée par l’analyse bioinformatique et statistique permettant l’analyse quantitative du transcriptome.
2. Du développement méthodologique afin de répondre au mieux aux demandes de nos collaborateurs et d’élargir notre offre de service.
3. Des formations et de l’animation scientifique.

Equipements

- Séquençage : 1 NextSeq500, 1 Miseq, accès aux séquenceurs HiSeq 2000/4000 Illumina du Genoscope à Evry
- Robotique : 1 Beckman Biomek FX
- Autres : 1 Sage Science PippinHT, 1 Covaris M220, 2 Agilent BioAnalyser, 1 Agilent TapeStation, 1 BMG Labtech CLARIOstar

Labels/démarche qualité
- Plateforme IBiSA depuis 2008
- Plateforme Stratégique Nationale par l’INRA depuis 2008- Certifiée ISO9001 depuis 2012

En savoir plus  : http://www.ips2.u-psud.fr/spip.php?article57

Responsable de la plateforme  :
Ludivine Soubigou-Taconnat

Contact  :

Ludivine Soubigou-Taconnat

POPS, Plateforme TranscriptOmique de l’iPS2
01 69 15 77 1
IPS2, Institute of Plant Sciences - Paris-Saclay
Bâtiment 630, rue de Noetzlin
Plateau du Moulon
91190 - Gif-sur-Yvette
Plateau du Moulon

mise à jour : février 2018