Mutualisation des compétences et des équipements français
pour l’analyse génomique et la bio-informatique

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Plateforme de bio-informatique de Toulouse

Expertise
Bioinformatique - Analyse de séquences - Assemblage - Annotation de génomes et de transcrits (codant, non codant) - Analyse des ARNnc – Analyse de la diversité ...

Accompagnement de projet (15 projets/an) :
RNAseq, RNAseq de novo, sRNAseq, Diversité, Re-séquençage ...

Cycles d’apprentissage : http://bioinfo.genotoul.fr/index.php/training-2/training/

Mise à disposition d’une infrastructure (équipements, logiciels, banques de données)

Equipement
Cluster de calcul (4352 coeurs à 8 Go de mémoire/coeur)
2 serveurs 64 coeurs à 1To de mémoire
1 serveur 240 coeurs à 3To de mémoire
400 To d’espace de travail partagé
1 Po d’espace de stockage

Principales réalisations
NG6 : http://ng6.toulouse.inra.fr/
RNAspace : http://rnaspace.org/
jflow : http://genoweb.toulouse.inra.fr:8090/app/index.html
jvenn : http://bioinfo.genotoul.fr/jvenn/example.html
rnabrowse : http://ngspipelines.toulouse.inra.fr:9012/

Certification / Assurance qualité
Certification ISO9001-2008 obtenue en 2010 et confirmée en 2013

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Responsables de la plateforme
Responsable technique : Christophe KLOPP
Responsable scientifique : Christine GASPIN

Toulouse – Auzeville / Unité BIA / INRA

Contacts
Christine Gaspin ou Christophe Klopp : anim.bioinfo@toulouse.inra.fr
+33 (0)5 61 28 52 82 ou +33 (0)5 61 28 50 36

En savoir plus
http://bioinfo.genotoul.fr/

mise à jour : 2017


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