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Séquençage "lectures longues synthétiques"

Le principe de préparation de banque selon la technologie 10x Genomics repose sur l’intégration, grâce à un système micro fluidique, de molécules de grande taille (60 à100kb) dans des micelles (GEMs) à l’intérieur desquelles l’indexage moléculaire est effectué.
Chaque GEM contient un code-barre moléculaire unique incluant une séquence amorce (1) pour l’amplification aléatoire du long fragment d’ADN capturé dans la GEM. Après amplification par incubation isotherme les GEMs contiennent des amplicons de quelques centaines de paires de bases (2). Une banque compatible pour le séquençage « en paire » est construite à partir des amplicons purifiés (3). L’ordonnancement des lectures courtes séquencées « en paire » est facilité par l’indexage moléculaire des amplicons issus des grands fragments (5).

Les plateformes à contacter pour la prise en charge de projets de séquençage « longues lectures synthétiques » :
CNRGH, Get, UCAGenomix, ENS, Institut Curie, MGX.

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