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Séquençage à "Longues Lectures"

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Basé sur la technologie SMRT (single molecule real time technology), le séquençage sur RSII et Sequel permet de produire de très longues lectures pour résoudre la couverture de régions de faible complexité telles que les régions répétées , déterminer les variants structuraux et haplotypes.
Une banque type SMRT est construite à partir de fragments de 10 à 20kb. Une fois leurs extrémités réparées, des adaptateurs simple brin y sont fixés en formant une boucle (SMRT bell), point d’ancrage pour la DNA polymérase ( Figure 1).
Un complexe insert – adaptateur – polymérase est déposé et immobilisé dans chaque puits du support de séquençage, illuminé par un système ZMW (Zero Mode Waveguides) permettant la détection de signal fluorescent en temps réel (Figure 2).
Le séquençage de l’insert circularisé permet de répliquer la lecture de l’insert pour obtenir une séquence consensus (CCS) de qualité.

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Les plateformes à contacter pour la prise en charge de projets de séquençage à "longues lectures" :
GeT, Institut Pasteur, Institut Curie, Gentyane.


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