Mutualisation des compétences et des équipements français
pour l’analyse génomique et la bio-informatique

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Plateforme de bio-informatique MIGALE


La plate-forme MIGALE a deux objectifs principaux :

- Mettre à disposition une infrastructure informatique dédiée à l’analyse des données génomiques :
en fournissant des moyens matériels, CPU, stockage, mémoire ;
en mettant à disposition des collections de données génomiques spécifiques ou génériques ;
en mettant en ligne des outils bio-informatiques pour analyser les données.

- Diffuser un savoir-faire en bio-informatique :
en organisant des formations ;
en ayant un rôle d’assistance et de conseil pour les utilisateurs ;
en ayant une activité de conception et de développement pour le traitement et l’analyse des données des utilisateurs.

Equipements 
L’infrastructure informatique de la plateforme MIGALE repose sur 75 serveurs sous Linux et une grappe de calcul de 580 processeurs. Plus de 65 banques de données génériques ou spécifiques sont mises à disposition et plus de 100 outils de bio-informatique sont disponibles (en ligne de commande ou à travers un serveur Galaxy) pour analyser les données.

Formations 
Migale organise un cycle de formation à la bio-informatique (14 modules pour une vingtaine de jours de cours). Près de 900 auditeurs ont été formés depuis 2005.

Développements 
La plateforme propose des développements informatiques (bases de données, sites web, etc&nbsp.) dans le cadre de projets avec des utilisateurs.

Principales réalisations 
MIGALE héberge la plate-forme d’annotation des génomes procaryotes AGMIAL (100 utilisateurs, 65 génomes annotés), fournit la logistique pour l’accompagnement de projets de génomique d’équipes de biologistes par l’unité MaIAGE (une quarantaine de projets depuis 2005) et abrite les projets de 500 utilisateurs.

Labels/ Démarche qualité :
IBiSA depuis 2010.
ISO9001 depuis Avril 2011

Responsables de la plateforme :
Jean-Francois Gibrat (responsable scientifique)
Valentin Loux (responsable opérationnel)
Unité Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l’Environnement (MaIAGE), centre de recherche de Jouy en Josas, INRA

En savoir plus : http://migale.jouy.inra.fr

Contact :
Jean-Francois Gibrat ou Valentin Loux
01 34 65 28 95
help.migale@jouy.inra.fr


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