Mutualisation des compétences et des équipements français
pour l’analyse génomique et la bio-informatique

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Plateforme Bioinformatique de l’Institut Curie (U900 Institut Curie – INSERM)


Intégration de données omiques, analyses de données omiques et autres, développement de méthodes et outils bioinformatiques et biostatistiques.
Données concernées : toute application de grand séquençage, tout type de puces, spectrométrie de masse, phénotypage à haut débit, données bas débit
Formations en bioinformatique et biostatistiques.
Participation à la coordination de la communauté (APLIBIO, IFB, France Génomique…)
Activité principale en oncologie moléculaire.

Equipements 
1 cluster de calcul avec 1280 coeurs et 8To de RAM
2 Po de stockage (1Po redondé)

Principales réalisations 
Environnement bioinformatique
- d’analyse grand séquençage (variants de séquence (exomes et génomes), HiC et autres C-seq, ChIPseq, smallRNA seq, RNAseq)
- d’analyse de puces génome, transcriptome et protéome (RPPA)
- d’analyse de spectrométrie de masse
- d’analyse de données de phénotypage cellulaire à haut débit
Participation à des essais cliniques en oncologie
Développement d’un système d’information pour l’intégration de données hétérogènes
Mise en place et gestion avec l’équipe système d’un cluster de calcul
etc.

Labels/ Démarche qualité
Démarche qualité en phase active
Pas de labels à ce jour

En savoir plus : http://u900.curie.fr

Responsables de la plateforme
Dr Emmanuel Barillot, Directeur
Dr Philippe Hupé, Directeur adjoint

Institut Curie, 26 rue d’Ulm, 75248 PARIS cedex 05
U900 Institut Curie - INSERM

Contacts
Emmanuel.Barillot@curie.fr
Philippe.Hupe@curie.fr


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