Mutualisation des compétences et des équipements français
pour l’analyse génomique et la bio-informatique

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Sequencing Platform Genomic Paris Centre - Institut Curie

-Targeted resequencing and whole genome sequencing, ChIP-seq, RNA-seq, SmallRNA.

- Fragment libraries, paired-end and mate pair libraries

- Amplicon sequencing, target enrichment, exome and whole genome sequencing

- Identification of polymorphisms, mutations and genome rearrangements..

Equipment :
HiSeq 2000 (600Gb)
HiSeq 2500 (600Gb en High Output et 120Gb en Rapid Run)
2 x Ion Torrent PGM (10Mb-1Gb)
Ion Proton (10Gb)

Main achievements :
- BRCA1 and BRCA2 (targeted) : C. Houdayer, D. Stoppa-Lyonnet,

- BRCAX (exome) :M-H. Stern, D. Stoppa-Lyonnet

- HPV (genome) : X. Sastre

- Yeast « Mutome » and « Meiotic recombination » (genome) : A. Nicolas

- RNAseq : Tumor Ewing (transcriptome) : O. Delattre

- Long Non-Coding RNAs : A. Morillon

- ChIP-Seq : Mouse Spi1 transcription factor : C. Guillouf, F. Moreau-Gachelin

- Using NGS for genetic diagnosis : BRCA1, BRCA2, RB1 (C. Houdayer, HPV (X. Sastre)

- Evaluation of AmpliSeq Cancer Panel of Life Technologies

Quality Assurance /Certification :
- IBISA
- Medical diagnosis

For further information :ngs.curie.fr

Scientist in charge :
Alain Nicolas
Platform Manager :
Thomas Rio Frio

Institut Curie, 26 rue d’Ulm 75248 Paris Cedex 05

Contact :
Alain Nicolas
Alain.Nicolas@curie.fr
01 56 24 65 20


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