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Microbial Biogeography of French soils

Le projet "Biogéographie microbienne des sols français" propose de caractériser la diversité taxonomique bactérienne des sols français en s’appuyant sur le Réseau de Mesure de la Qualité des Sols (RMQS). Ce réseau comprend 2200 sols échantillonnés sur l’ensemble du territoire français, avec une caractérisation physicochimique et environnementale très précise pour chacun des sols. La biodiversité microbienne sera analysée grâce à des techniques de séquençage massif (pyroséquençage) des gènes taxonomiques (rrs) directement à partir de l’ADN extrait des sols. Ce projet permettra i) de quantifier et référencer précisément la biodiversité des sols français, ii) de définir sa distribution spatiale à l’échelle du territoire (biogéographie, cartobiosphère), et iii) de comprendre la régulation et les évolutions de la biodiversité des sols sous différentes pressions environnementales (agricoles, industrielles, urbaines, climatiques,…). Ce projet se positionne en tant que « projet de recherche fondamentale » tout en affichant des objectifs parallèles finalisés, qui consistent à développer des bioindicateurs microbiens des sols, via l’élaboration de référentiels basés sur le niveau de diversité mais aussi sur la composition taxonomique de cette diversité afin de pouvoir diagnostiquer la qualité des sols en termes de services dans un contexte de changement climatique tels que : le patrimoine biologique, le recyclage des éléments minéraux, le cycle du carbone, le pouvoir épurateur du sol et la régulation de l’atmosphère.